Az érintett megyék népegészségügyi szakigazgatási szervei, az Országos Tisztifőorvosi Hivatal és az Országos Epidemiológiai Központ szakmai közreműködésével az Országos Katasztrófavédelmi Főigazgatóság koordinálja a szúnyoggyérítéssel összefüggő feladatokat. Fontos azonban tudni, hogy a szúnyogok ellen egyénileg is védekezhetünk.
Az árvíz levonulását követően a visszamaradó, álló, pangó vizek a csípőszúnyog lárvák nagy tömegének fejlődéséhez teremtenek ideális feltételeket. Emellett az időjárási viszonyok, vagyis a következő napokban várható felmelegedés is kedvező a szúnyoglárvák fejlődésének. A szúnyoggyérítés előtt rovartani ismeretekkel rendelkező szakemberek segítenek felmérni, hogy mikor és hol lesz szükség védekezésre.
A szúnyogirtást - mind a földi, mind a légi úton történő kijuttatást - szakvállalatok végzik. Ezek a megfelelő tárgyi (helikopter, repülőgép, terepjáró gépkocsi, szúnyogirtó szer stb.) és személyi feltételeken túlmenően az irtószer-kijuttatásban is komoly szakmai gyakorlattal rendelkeznek. A repülőgépes szúnyogirtással foglalkozó szolgáltatók megrendelésre dolgoznak, a művelet elvégzéséhez szükséges engedélyt az Országos Tisztifőorvosi Hivatal adja ki. Tekintettel a rendkívüli dunai árhullámra, gyorsított eljárással bírálják el a kérelmeket, hogy az irtást adminisztrációs akadályok ne hátráltassák. Fontos kiemelni, hogy a szervezett védekezésben használható szerek az emberre nem veszélyesek.
A csípőszúnyogok vérszívása ellen egyénileg a szabadban riasztószer, valamint füstképző spirál alkalmazásával, zárt térben légtérkezelő aeroszol palackkal, valamint a párologtatás elvén működő szúnyogirtó folyadékokkal és lapokkal védekezhetünk. A kellemetlen csípéseket elkerülhetjük úgy is, hogy a szúnyogok fő aktivitási idejében (alkonyatkor) zárt térben tartózkodunk, emellett a nyílászárókra szerelt szúnyoghálók is segíthetnek a szúnyogok távol tartásában. Fontos, hogy az esővízgyűjtő tartályokban, kerti medencében tenyésző szúnyoglárvák fejlődését is megakadályozzuk.
Az egészségügyi kártevőnek minősülő szúnyogok távol tartására alkalmas készítmények, a szúnyogriasztó szerek Magyarországon csak az Országos Tisztifőorvosi Hivatal (OTH) engedélyével forgalmazhatók. Az engedély számát - amely az "OTH" betűkkel, illetve a 2011. július 1-je után engedélyezett szerek esetében "JÜ" betűkkel kezdődik, majd számokkal folytatódik - a termék címkéjén fel kell tüntetni. Az OTH engedély kiadását minden esetben megelőzi a termék hatékonysági vizsgálata, amelyet az Országos Epidemiológiai Központ végez el saját szúnyogtenyészetén. Szúnyogriasztó szer vásárlása előtt feltétlenül érdemes ellenőrizni a címkén a fenti betű- és számkombináció meglétét, mert csak az engedélyezési eljáráson átesett terméktől várható el kellő hatékonyság. A szúnyogriasztás céljára árusított karkötők forgalomba hozatali engedéllyel nem rendelkeznek, hatékonyságuk nem igazolt.