A közlemény szerint Horváth Péter, az Eötvös Loránd Kutatási Hálózathoz (ELKH) tartozó SZBK igazgatója, a Biomag kutatócsoport vezetője és munkatársai partnereikkel, a Bristoli Egyetem kutatóprofesszoraival, Peter Cullennel és Yohei Yamauchival közösen kimutatták, hogy az influenzával kapcsolatban folytatott kutatásaik során felfedezett, eddig ismeretlen szereplőn - a gazdasejt felszínén található neuropilin-1 (NRP1) receptoron - keresztül az új típusú koronavírus be tud jutni a gazdasejtbe.
Új terápiás lehetőség jöhet
A világon számos kutatólabor dolgozik azon, hogy a koronavírus-fertőzés ( COVID-19 ) folyamatát megismerve elősegítse a hatékony kezelés kifejlesztését. A kutatóknak eddig az angiotenzin-konvertáz enzim 2-t (ACE2) sikerült azonosítani, amelyen keresztül a vírus képes bejutni a sejtbe. Az SZBK mesterségesintelligencia-modellje alapján végzett kutatási eredmények azonban azt mutatják, hogy az NRP1 a COVID-19 elleni terápia új, második célpontja lehet.
A neuropilin-1 (NRP1) a gazdasejt felszínén megtalálható receptor, amelyhez a koronavírus kötődni képes az S (Spike) elnevezésű fehérjén keresztül. Ebből az S fehérjéből enzimatikus hasítással képződik S1 fehérje, amely egyik végén - az úgynevezett C-terminális végen - rendelkezik egy speciális mintázattal, a "C-end rule"-lal (CendR). Ennek a régiónak a segítségével képes az új koronavírus az NRP1-hez kapcsolódni, és bejutni a sejtbe. A fertőzött sejtek több sejtmaggal rendelkeznek, mint az egészséges sejtek. Ennek a különbségnek a detektálásához és mennyiségi meghatározásához fejlesztett ki Horváth Péter és csapata egy, a világon egyedülállónak számító módszert, amely a mesterséges intelligencia legújabb irányán, a mélytanuláson alapul, és amelynek segítségével nagyon pontos mikroszkópos analízist képesek végezni a kutatók.
Rendhagyó módszer
Korábban az influenzakutatások kapcsán az NRP1-gén szűrésére is hasonló módszertant használt a szegedi kutatócsoport. Az intelligens algoritmusoknak - hasonlóan az önvezető autók irányításához vagy a közösségi médiumok intelligens képelemző algoritmusaihoz - azonban hatalmas tanulóadatbázisokra van szükségük, amely a kutatócsoportnak korábban nem állt a rendelkezésére. Ezért egy olyan hibrid módszert alakítottak ki, amely során egy mélytanuló metódus mesterséges példákat generál, és ezek alapján tanít egy másik intelligens módszert. A módszert nemrég publikálták a rendszerbiológia legrangosabb folyóiratában, a Cell Systems-ben.
Az egész násznépet tesztelték koronavírusra egy győri lagzi előtt - a részletekért olvassa el társportálunk, az nlc.hu cikkét!