A fantomfájdalom diagnosztizálása viszonylag könnyű feladat, kezelése viszont annál nehezebb. Gyógyszeres kezelés, idegblokád, masszázs, gyógytorna és tükörterápia egyaránt hatásos lehet.
A gyógyszeres kezelésről
A gyógyszeres kezelés lényege, hogy először enyhébb hatású fájdalomcsillapítókat kezdjen szedni a páciens, és szükség esetén fokozatosan váltsanak át vényköteles, erősebb fájdalomcsillapítókra. A legenyhébb esetekben még a vény nélkül kapható, nem-szteroid gyulladáscsökkentő szerek ( ibuprofen , paracetamol ) is hatásosak lehetnek, bár hosszabb távú szedés esetén már ezeknek is meglehetősen erős mellékhatásai vannak, mint gyomorbántalmak és májkárosodás veszélye. Később azonban antidepresszánsokat, illetve komolyabb, orvos által előírt fájdalomcsillapító gyógyszerekre (baclofen, lidocain, calcitonin) is szükség lehet.
Idegblokád, TENS kezelés
Az idegblokád egy rendkívül precíz fájdalomcsillapítási módszer, amely olyan, nagyon erős fájdalmak esetén segíthet, amelyet a gyógyszerek már nem képesek enyhíteni. Gyakran használják daganatos fájdalmak enyhítésére, de fantomfájdalom ellen is hatásos. Az idegblokád alapú kezelés lényege, hogy egyes idegek működését meggátolja, így megszűnik a fájdalomérzet. A fantomfájdalmakat a TENS készülékekkel történő kezelés is enyhítheti.
Egyéb kezelések
Mivel a nagyon erős vagy nagyon gyakori fantomfájdalom gyakoribb azoknál a pácienseknél, akiknél fokozott lelki megterhelés, stressz, esetleg depresszió áll fenn, a fantomfájdalom kezelésénél fontos a páciens pszichés támogatása. Az amputáció tényének feldolgozását egyébként is segíti, de erős fantomfájdalmak esetén különösen ajánlott egyéni vagy csoportos pszichoterápia.
A fantomfájdalom kezelhető ezeken kívül gyógytornával, és masszázzsal is, és gyakran a protézisek, művégtagok is támogatják az agyat, hogy elfogadja az amputációt. Bűvésztrükknek tűnhet, de sok esetben hatásos az úgynevezett tükörterápia : ennek során a páciens egy tükörben nézi ép végtagját, és az az érzése lesz, hogy a hiányzó végtagot látja és mozgatja. Ez a módszer sok esetben gyengíti vagy teljesen meg is szünteti a fájdalmat.